季铵盐类消毒剂为中低效消毒剂，可以作为一般消毒剂使用。原理为：
1、这类杀菌剂的作用机理主要是阳离子通过静电力、氢键力以及表面活性剂分子与蛋白质分子间的疏水结合等作用，吸附带负电的细菌体，聚集在细胞壁上，产生室阻效应，导致细菌生长受抑而死亡；同时其憎水烷基还能与细菌的亲水基作用，改变膜的通透性，继而发生溶胞作用，破坏细胞结构，引起细胞的溶解和死亡。
2、这类杀菌剂具有高效、低毒、不易受ph值变化的影响、使用方便、对粘液层有较强的剥离作用、化学性能稳定、分散及缓蚀作用较好等特点；但存在易起泡沫、矿化度较高时杀菌效力降低、容易吸附损失。如果长期单独使用，易产生抗药性等缺点。